Εξαιτίας της επίθεσης ενός καρχαρία στη γειτονιά όπου ζούσαν οι γονείς του κλοουνόψαρου Nemo, το μόνο ψάρι που διασώζεται είναι ο πατέρας του, Marlin, και το αυγό του Nemo που ακόμη δεν έχει εκκολαφθεί. Η υπερπροστατευτικότητα του Marlin στη μετέπειτα ζωή του μοναχογιού του θα τον οδηγήσει σε μια επικίνδυνη πράξη, που θα έχει ως αποτέλεσμα την απαγωγή του Nemo από δύτες. Ο πατέρας του θα πρέπει να περάσει από χίλια κύματα για να τον σώσει και να τον ξαναφέρει κοντά του. Στο δρόμο του θα γνωρίσει την Dory, το πιο καλόκαρδο, αλλά και το πιο αφηρημένο ψάρι του πλανήτη, που θα τον πείσει ότι όλα είναι εφικτά, αρκεί να τα πιστεύεις πραγματικά...